1、結構區別：CNC加工中心至少是三軸控制，而CNC數控車床是兩軸控制。
2、刀具區別：CNC加工中心有刀庫，CNC數控車床用的是刀架。CNC加工中心刀庫分類比CNC數控車床刀架分類要多，有圓盤式、斗笠式、鏈式、飛碟式、同動式等等，大部刀庫的刀具容量都要比CNC數控車床刀架的刀具容量大。
3、加工范圍不同：CNC加工中心的加工范圍比CNC數控車床加工范圍要大。CNC數控車床主要是用來加工回轉零件。
4、編程區別 ：CNC加工中心和CNC數控車床編程在某些方面比較相似，但是CNC加工中心編程更為復雜一些。

CNC的優點：
1、大量減少工裝數量，加工形狀復雜的零件不需要復雜的工裝。如要改變零件的形狀和尺寸，只需要修改零件加工程序，適用于新產品研制和改型；
2、加工質量穩定，加工精度高，重復精度高，適應飛行器的加工要求；
3、可加工常規方法難于加工的復雜型面，甚至能加工一些無法觀測的加工部位。
數控車床的優點：
1、加工精度高，具有穩定的加工質量；
2、可進行多坐標的聯動，能加工形狀復雜的零件；
3、加工零件改變時，一般只需要更改數控程序，可節省生產準備時間。